Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms