Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms