Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms