Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms