Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms