Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms