Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL7P80098 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL7P80098 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms