Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HBBP68871 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms