Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms