Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms