Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3P61158 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms