Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms