Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms