Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms