Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms