Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms