Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms