Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms