Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms