Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAP3P28838 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
LAP3P28838 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAP3P28838 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms