Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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