Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms