Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms