Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF3P18847 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms