Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGAP02671 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGAP02671 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGAP02671 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms