Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms