Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms