Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRATO95237 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRATO95237 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms