Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAK2O60296 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms