Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms