Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS6O14544 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms