Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8B2A6NJW9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms