Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT87PA6NCN2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms