Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM129A0AVI4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms