Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARP3Q9Y6F1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PARP3Q9Y6F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PARP3Q9Y6F1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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