Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms