Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms