Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBNO2Q9Y2G9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms