Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms