Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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