Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms