Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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