Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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