Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS6KB2Q9UBS0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms