Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms