Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms