Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms