Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms