Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms