Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms